Pengklonan dan penjujukan beberapa Fragmen Retrovirus Endogenus daripada ikan marin Sabah

Roziah Kambol, and Julian Ransangan, Pengklonan dan penjujukan beberapa Fragmen Retrovirus Endogenus daripada ikan marin Sabah. (Unpublished)

[img] Text
Pengklonan dan penjujukan beberapa Fragmen Retrovirus Endogenus daripada ikan marin Sabah.pdf

Download (82kB)

Abstract

Sebanyak 78 sampel ikan marin telah diperolehi dari perairan Sabah. Dari jumlah itu, 78 sampel telah diekstrak DNA mereka dengan menggunakan kaedah manual dan kit komersil. Kaedah pengekstrakan DNA genomic secara manual memberikan kuantiti DNA yang tinggi pada 60 hingga 1225 ug/ml DNA per 10mg sampel tisu ikan. Sebaliknya kaedah pemencilan DNA menggunakan kit komersH memberlkan nHal antara 25 hingga 230 ug/ml per 10mg sampel tisu ikan. Daripada 78 sampel, 44 sampel melalul penyaringan peR kall pertama untuk memandng keluar gen transkriptase berbalik dari spesies ikan marin Sabah. Selanjutnya, hanya 20 sampel melalui penyaringan kali kedua dan hanya 8 sam pel dikaji lanjut melalul purifikasi DNA. Dari 8 sampel Itu, hanya 2 yang berjaya diklonkan dan dijujukkan DNA mereka. Dari 2 sampel yang dijujukkan DNAnya, hanya 1 sam pel iaitu sampel dari ikan Mong yang telah dikenalpasti mempunyai gen transkriptase berbalik di dalam genom nya. Jujukan itu diberi nama RV-Mong dan mempunyai panjang nukleik asid 584 pasangan bes DN.A dan 194 asid amino. Tiada kodon penamat diperhatikan pada jujukan DNA RV-Mong dan menunjukkan bahawa retrovirus endogenous inl baru sahaja memasuki genom ikan Mong. Analisa asid amino pada RV-Mong telah mendapati bahawa ia mempunyai pad~man yang signifikan dengan retrovirus endogenus dari ikan Puffer (Tetraodon nigriviriois) dan ikan Zebra (Danio rerio).

Item Type: Research Report
Uncontrolled Keywords: Marine , fish , DNA genomic extraction technique , gene , Sabah
Subjects: Q Science > QR Microbiology
Divisions: SCHOOL > School of Science and Technology
Depositing User: Noraini
Date Deposited: 30 Sep 2019 00:29
Last Modified: 30 Sep 2019 00:29
URI: http://eprints.ums.edu.my/id/eprint/23253

Actions (login required)

View Item View Item