Muhammad Azfar Abdullah (2005) DNA fingerprinting of Pineapple (Ananas comosus var, comosus) using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Universiti Malaysia Sabah. (Unpublished)
|
Text
ae0000000836.pdf Download (2MB) | Preview |
Abstract
Penanda RAPD (random amplified polymorphic DNA) yang dihasilkan oleh primer yang rawak telah berjaya digunakan untuk mengesan polimorfisma genetik di antara nenas (Ananas comosus var. comosus) yang berlainan variasi, iaitu Paun, Madu dan Sarawak yang diambil dari Babagon, Tamparuli dan Sipitang. Perhubungan genetik di antara variasi-variasi juga telah ditentukan. DNA diekstrak menggunakan protokol salting out (Miller, 1988) yang telah diubah suai. PCR dijalankan dengan menggunakan dua sampel bagi setiap variasi menggunakann primer RAPD OPA4, OPA8, dan OPA10. Produk PCR dipisahkan di dalam 2% gel agarose. Sejumlah 32 fragmen DNA dengan saiz julat antara 100-1300 bp telah dihasilkan daripada amplifikasi PCR, di mana 68.7% fragmen DNA adalah polimorfik. Jarak genetik yang ditentukan (Nei & Li, 1979) di antara dan sesama variasi menunjukkan nilai antara 0.1330-0.3191. Produk amplifikasi putatif yang variasi-spesifik juga telah diperoleh (OPA4.3 dan OPA10.11 untuk variasi Paun; OPA4.7 untuk variasi Madu).Dinyatakan di sini amplifikasi ini boleh digunakan sebagai penanda diagnostik bagi pengecaman sesuatu variasi. Nilai jarak genetik yang diperoleh telah digunakan untuk menghasilkan satu Neighbour-Joining dendrogram. Analisis kelompok ini menunjukan terdapat dua kumpulan utama, di mana kumpulan pertama terdiri daripada variasi Paun dan Madu, manakala kumpulan kedua terdiri hanya daripada variasi Sarawak. Maklumat ini adalah penting bagi membuat keputusan yang baik bagi kemajuan tanaman ini.
| Item Type: | Academic Exercise |
|---|---|
| Keyword: | Varieties of pineapple, Ananas comosus var. comosus, Babagon, Tamparuli, Sipitang |
| Subjects: | Q Science > QK Botany > QK1-989 Botany > QK710-899 Plant physiology |
| Department: | SCHOOL > School of Science and Technology |
| Depositing User: | ADMIN ADMIN |
| Date Deposited: | 04 Jan 2013 18:21 |
| Last Modified: | 13 Oct 2017 15:06 |
| URI: | https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/5626 |
Actions (login required)
 |
View Item |